Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RybpQ8CCI5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RybpQ8CCI5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms