Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nhlrc3Q8CCH2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Nhlrc3Q8CCH2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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