Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nrip1Q8CBD1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms