Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nhsl1Q8CAF4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nhsl1Q8CAF4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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