Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
4930507D05RikQ8C9C9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms