Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cwc22Q8C5N3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms