Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc90bQ8C3X2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms