Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TiparpQ8C1B2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TiparpQ8C1B2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms