Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pm20d1Q8C165 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pm20d1Q8C165 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms