Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp47Q8BY87 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp47Q8BY87 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp47Q8BY87 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp47Q8BY87 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp47Q8BY87 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp47Q8BY87 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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