Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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