Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx1bQ8BX32 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx1bQ8BX32 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms