Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330017A01RikQ8BU47 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
E330017A01RikQ8BU47 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330017A01RikQ8BU47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms