Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms