Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp54Q8BL06 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms