Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpc2Q8BKV1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms