Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6bQ8BKI2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms