Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubash3bQ8BGG7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms