Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htatsf1Q8BGC0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms