Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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