Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2-M10.2Q85ZW9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2-M10.2Q85ZW9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms