Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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H2-M10.4Q85ZW8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.4Q85ZW8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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