Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2-M10.3Q85ZW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-M10.3Q85ZW6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms