Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc50Q810U5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc50Q810U5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms