Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfascQ810U3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms