Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Negr1Q80Z24 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Negr1Q80Z24 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms