Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2bQ80XK6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms