Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Zbed4Q80WQ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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Zbed4Q80WQ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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Zbed4Q80WQ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbed4Q80WQ9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
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