Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Npm2Q80W85 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Npm2Q80W85 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Npm2Q80W85 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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