Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Pcsk9Q80W65 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Pcsk9Q80W65 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Pcsk9Q80W65 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Pcsk9Q80W65 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Pcsk9Q80W65 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pcsk9Q80W65 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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