Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AknaQ80VW7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AknaQ80VW7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AknaQ80VW7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms