Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pja2Q80U04 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms