Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NischQ80TM9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NischQ80TM9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
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