Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2q1Q7TSS2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2q1Q7TSS2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms