Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccp110Q7TSH4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccp110Q7TSH4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms