Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPY4

Pramel5, Pramel5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel5Q7TPY4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pramel5Q7TPY4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramel5Q7TPY4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramel5Q7TPY4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms