Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap1s3Q7TN05 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap1s3Q7TN05 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms