Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Abcg2Q7TMS5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcg2Q7TMS5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms