Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Uhrf2Q7TMI3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms