Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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