Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2r2Q6ZWZ2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2r2Q6ZWZ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms