Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27lQ6ZWY3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps27lQ6ZWY3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms