Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SpopQ6ZWS8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms