Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ncapd3Q6ZQK0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ncapd3Q6ZQK0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ncapd3Q6ZQK0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms