Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Topbp1Q6ZQF0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Topbp1Q6ZQF0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms