Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nemp1Q6ZQE4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nemp1Q6ZQE4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms