Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Efr3bQ6ZQ18 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efr3bQ6ZQ18 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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