Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chsy1Q6ZQ11 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chsy1Q6ZQ11 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms