Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smpd4Q6ZPR5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms