Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Znf653Q6YND2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms